Принцип
EST (Виражений послідовність тегів), виражена послідовність тегів
EST випадковим чином вибирається з кДНК-клона 5'-кінця і 3'-кінця однієї послідовності, щоб отримати часткову послідовність кДНК Коротше кажучи, являє собою повний геном невеликої частини його довжини в базі даних, зазвичай в межах від 20 до 7000bp, Середня довжина 360 ± 120bp. EST від певних обставин загальної РНК з тканини кДНК-бібліотеки, так EST можна пояснити і організації експресії генів.Дорожня карта технологій
По-перше, зразок був витягнутий з мРНК, під дією зворотної транскриптази використанням оліго (ДТ) в якості грунтовки для ОТ-ПЛР синтезу кДНК, а потім вибрати відповідний носій бібліотеку кДНК для кожного штаму сортування вставки кожного штаму фрагмент сайти клонування в відповідності з вектором праймери були сконструйовані автоматизованої послідовності в часі, що процес генерації EST послідовностей.
Застосування
EST області, як експресія генів, що кодують молекули ДНК етикетці в силу дуже консервативної послідовності має свій особливий характер, і від Не-виражена послідовність тегів (наприклад, AFLP, RAPD, SSR і т.д.) частіше, ніж через сім'ю і види обмежень, EST маркерів в віддалено споріднених видів порівняльної геноміки та порівняльна якісна риса мапі зчеплення інформація особливо корисна. Крім того, послідовності ДНК, відсутність цільового виду від інших видів, також можуть бути використані для виду EST Генетичне картування корисним, прискорення інформацію споріднених видів швидке перетворення. Зокрема, EST роль проявляється в: ⑴ використовується для побудови генетичних карт і фізичної карти геному; ⑵ в якості зонда для гібридизації радіоактивних; ⑶ для позиційного клонування; ⑷ щоб знайти нові гени; ⑸ як молекулярний маркер; ⑹ використання у вивченні біологічних поліморфізм популяцій; ⑺ використовується для вивчення функцій генів; ⑻ допомогою розробки лікарських засобів, поліпшення сортів; ⑼ сприяти розвитку генні чіпи та інші аспекти. Саме тому, що ці EST показала великий потенціал, вона була повністю використана і розвитку.
Вивчення геному людини, тобто відрізняється від "Вся стратегія геному", "ДНК" стратегії, як міра тільки транскрипції послідовності ДНК, транскрипції генів продукту визначається зворотної транскрипції мРНК комплементарної ДНК --- cDNA.cDNA представник генної послідовності, що кодує білок. EST є фрагментом ДНК, зазвичай 200-400 нуклеотидів право. КДНК повної довжини молекули може мати багато EST, але дане EST іноді представляють конкретну молекулу кДНК. Перекриття обох кінцях консенсусної послідовності EST можуть бути зібрані в орендована (орендована), поки Асамблея не є повнорозмірною кДНК послідовності, це було б рівнозначно клонований ген кодує послідовності. EST розташований в геном, геном можуть бути нанесені в якості маркера послідовності.
|
